Posebne strukture fluorescenčnih mikroskopov vključujejo:
(1) Sistem barvnih filtrov
Blok barvnega filtra je pomemben del fluorescenčnega mikroskopa, njegove glavne komponente pa sestavljajo prvi pregradni filter za vzbujevalno svetlobo, drugi pregradni filter za emisijsko svetlobo in zrcalo, ki deli žarek. Modeli barvnih filtrov in imena različnih proizvajalcev so pogosto neskladna.
1. Filter vzbujalne svetlobe in filter emisijske svetlobe: Na podlagi značilnosti svetlobnega vira in fluorescentnega pigmenta so običajno izbrane naslednje tri vrste ujemanja, ki zagotavljajo vzbujevalno svetlobo znotraj določenega območja valovnih dolžin in omogočajo, da fluorescenca, ki jo vzbudi vzorec, preide skozi in doseže okular za slikanje.
UV vzbujanje: Filter vzbujalne svetlobe lahko prepušča UV svetlobi in blokira prehod vidne svetlobe nad 400 nm. Ustrezen emisijski svetlobni filter omogoča prehajanje modre svetlobe in svetloba v vidnem polju je videti modra, na primer pri barvanju z DAPI.
Vzbujanje modre svetlobe: Filter vzbujalne svetlobe lahko omogoči prehod modri svetlobi in blokira svetlobo drugih valovnih dolžin. Ustrezen emisijski svetlobni filter omogoča prehajanje zelene svetlobe, kot so GFP markerji za barvanje.
Vzbujanje zelene svetlobe: Filter vzbujalne svetlobe omogoča prehod zelene svetlobe in blokira svetlobo drugih valovnih dolžin. Ustrezen emisijski svetlobni filter običajno omogoča prehajanje rdeče svetlobe, kot je barvanje z rodaminom.
2. Polprosojni in polodsevni barvni filter: njegova funkcija je, da popolnoma blokira prehod vzbujalne svetlobe in jo odbija; In oddajajo svetlobo v ustreznem območju valovnih dolžin. Njegov model ustreza filtru vzbujalne svetlobe in filtru emisijske svetlobe.
(2) Objektiv in okular
Uporabljajo se lahko različni objektivi, vendar je najbolje izbrati leče z dodano skalo in zmanjšanjem kromatskih aberacij, saj je njihova lastna fluorescenca izredno nizka, njihova zmogljivost prepustnosti svetlobe (območje valovnih dolžin) pa primerna za fluorescenco. Ker je fluorescenčna svetlost slike v polju mikroskopa premo sorazmerna s kvadratom razmerja zaslonke leče objektiva in obratno sorazmerna z njeno povečavo, je treba za izboljšanje svetlosti fluorescenčnih slik uporabiti lečo objektiva z večjim razmerjem zaslonke. Zlasti pri vzorcih z nezadostno fluorescenco je treba uporabiti lečo objektiva z velikim razmerjem zaslonke in visoko prepustnostjo svetlobe, skupaj z okularjem z najmanjšo možno povečavo.
(3) Druge optične naprave
Odsevna plast ogledala je običajno prevlečena z aluminijem, ker aluminij absorbira manj ultravijolične in vidne svetlobe v modro vijoličnem območju, saj odbije več kot 90 % (medtem ko ima srebro odbojnost le 70 %). Na splošno se uporabljajo ravna ogledala. Leča za fokusiranje, posebej zasnovana in izdelana za fluorescenčne mikroskope, je izdelana iz kremenčevega stekla ali drugega stekla, ki prepušča ultravijolično svetlobo. Naprava padajoče svetlobe je poleg funkcije prepustnega vira svetlobe primernejša za neposredno opazovanje neprozornih in polprosojnih vzorcev, kot so debele plošče, filtrske membrane, bakterijske kolonije, tkivne kulture in drugi vzorci. V zadnjih letih je bilo razvitih veliko novih vrst fluorescenčnih mikroskopov z uporabo naprave za padajočo svetlobo, znane kot fluorescenčni mikroskop za padajočo svetlobo.
